增值税的计算方法有直接计算法和间接计算法两种。世界各国普遍采用间接法(扣税法)，我国的增值税计算也统一采用扣税法。
1.直接计算法
直接法是指按照产品销售额扣除法定扣除项目(外购的原材料、固定资产、燃料动力、包装物等)后的余额作为增值税，再乘以相应的税率计算应纳税额的方法。
在直接计算法下，计算增值税的方法又可分为以下两种。
1)加法
加法是将构成增值额的各要素相加来计算增值额。其计算公式为
增值额=本月发生的工资 利润 租金 其他属于增值税项目的数额
应纳税额=增值额×增值税率
这种方法在理论上可行，而在实际业务中却存在很多问题，比如要准确计算和详细核实这些增值项目，一是工作量大，二是非常复杂，因此在国际上没有一个国家采用。
2)减法
减法(扣除法)是以产品销售额扣除法定扣除额后的余额作为增值额，扣除项目一般包括外购的原材料、固定资产、燃料动力、包装物等金额。其计算公式为
增值额=本期销售额-规定扣除的非增值额
应纳税额=增值额×增值税率
这种方法在实际业务中也同样存在着增值项目难以划分等问题，所以该方法一般也不被采用。
2.间接计算法
间接法也叫扣税法，是不直接计算增值额，而是采用抵扣税款的方式计算应纳税额的方法。
其计算公式为
应纳税额=销售额×增值税率-本期购进中已纳税额
实行扣税法计算应纳税额时，理论上可行，实务中便于操作，是以购货发票所列已纳税款为依据进行进项税款扣除的。目前，世界各国普遍采用扣税法，我国增值税也统一采用扣税法。
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