注册股与普通股的区别在于：不同的概念、不同的效果和不同的具体操作。中国发行的普通股具体为批准股，与注册股的区别可视为批准制与注册制的区别。批准制度是指发行人申请发行证券时，不仅要公开披露与发行证券有关的信息，还要符合法律规定的发行条件。
1、两者观念不同
注册制度和批准制度作为两种不同的证券发行监管制度，反映了不同的政府监管理念，本质上是政府在证券发行过程中应该发挥什么作用。从审批制度来看，证券发行人和投资者都有优缺点，不是每个人都有能力做出准确的判断，所以政府需要做出决定；在注册制度的支持者看来，在既定制度下，只要个人和企业有完整的信息和理性，个人追求效用最大化，企业追求利润最大化，各种稀缺资源就能在竞争中达到平衡。然而，个人和企业的理性也是有限的。有限的理性意味着没有人能预测竞争市场中的优缺点。也就是说，证券发行人和投资者在市场上处于平等对称的地位，没有人有资格判断其优缺点，包括政府。在注册制度下，政府不决定是否批准证券发行，而是要求证券发行人提供投资者自己判断证券发行人及其发行的证券是否具有投资价值的综合信息。充分尊重市场经济自由、市场主体行为自主、监管部门规范效率的理念。
2、两者效果不同
注册制度和审批制度各有优缺点，这也是两者长期共存的根源。注册制度的优点是：对于证券发行人，所有愿意发行证券的公司都可以公平获得发行证券的机会；对于证券监管机构，正式审查缩短了证券审查和发行的时间，提高了监管机构的效率，降低了系统运行成本；对于投资者，将证券发行交给市场，选择有利于市场机制的培育和成熟，培养和提高投资者接受信息和合理投资的能力，投资者的成熟理性是证券市场理性的基础。
3、两者具体操作不同
由于不同的概念和特点，注册制度和审批制度在法律基础、市场结构、监管模式、审计机构和审计内容上存在差异。
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