公允价值变动用“公允价值变动损益”科目核算，属于损益类账户，借方记减少，贷方记增加。可供出售金融资产公允价值变动，用“交易性金融资产—公允价值变动”科目来核算可供出售金融资产在资产负债日时其公允价值与账面价值之间的差额。
如果交易性金融资产公允价值低于账面金额，其会计分录如下：
借：公允价值变动损益，
贷：交易性金融资产—公允价值变动。
如果交易性金融资产公允价值高于账面金额，其会计分录如下：
借：交易性金融资产—公允价值变动，
贷：公允价值变动损益。
