首先，需要根据企业所处的行业来决定。通常情况下，这些费用会被计入原材料或库存商品。对于餐饮行业或是销售公司而言，它们最终会归入主营业务成本中。
对于一般纳税人来说，如果他们购买的是自产自销的农产品，那么可以享受9%的抵扣优惠；而对于经过深加工的产品，则可以在原有基础上再扣除1%。专票则是按照专票上标注的金额来进行抵扣。
依据《财政部 国家税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》(财税〔2017〕37号），二、纳税人购进农产品，按下列规定抵扣进项税额：(一)除本条第(二)项规定外，纳税人购进农产品,取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书的，以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额；从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额；取得(开具)农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
(六)《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条第二款第(三)项和本通知所称销售发票，是指农业生产者销售自产农产品适用免征增值税政策而开具的普通发票。
