合伙企业转让股权的税务处理可以分为两种情况：
一、自然人投资者涉税处理，依据财税〔2000〕91号文件的规定，当自然人投资者获得股权转让
收益时，该收益应视为其生产经营所得，并按照《个人所得税法》中关于“个体工商户的生产经营所得”的税率范围（5%~35%）进行计算和缴纳个人所得税。
二、企业投资者涉税处理，根据财税〔2008〕159号文件的规定，每个合伙人都被视为纳税义务人。如果合伙企业的合伙人是自然人，那么他们需要缴纳个人所得税；如果是法人或其他组织，则需缴纳企业所得税。
进一步地，企业投资者从合伙企业分得的净收益也需要缴纳企业所得税。在缴纳了所得税之后，这部分
利润应当作为企业投资者对合伙企业的分红进行处理。对于这些确认为分红所得的收入，尽管根据我国的《企业所得税法》及其实施条例，居民企业直接投资于其他居民企业所获得的股息、红利等权益性投资收益属于免税收入，但由于个人独资企业和合伙企业不适用《企业所得税法》，且居民企业的定义不包括合伙企业，因此，企业投资者从合伙企业获得的已缴税后的利润并不在免税范围内，必须将其并入企业的其他应税所得中，按规定计算并缴纳企业所得税。
