增值税发票综合服务平台的使用流程如下：
1. 首先，需要插上金税盘或税控盘、UKEY，然后打开发票勾选平台，输入密码，点击登录。
2. 在平台上，勾选进项发票，勾选完成后，点击抵扣勾选，再点击抵扣勾选统计。
3. 然后，点击申请统计。
4. 接下来，点击统计查询。
5. 之后，点击确认签名。
6. 在弹出的对话框中，输入证书密码，点击确定。
7. 最后，页面显示确认签名即可。
