当员工的工资和社保不在同一个单位发放时，该员工就属于在中国境内两处以上取得工资薪金的居民个人。在这种情况下，应当由母子公司分别预扣预缴个人所得税，员工次年自行办理汇算清缴。
在处理个人所得税时，如果工资和社保在同一单位发放和扣缴，那么只需在该单位进行一次预扣预缴；如果工资和社保在两个不同的单位发放，则这两个单位都需要分别进行预扣预缴，并由员工在次年自行办理汇算清缴。
对于企业所得税的处理，如果员工为某个企业提供服务，那么相关的费用就应该在该企业列支。如果发放单位与列支单位不一致，需要进行结算，并确保税前扣除凭证的合规性。
