年底双薪的个税处理涉及多种情况，需根据实际收入结构进行合理筹划。
1、如果员工仅获得年底双薪而无其他年终奖金
此时，年底双薪可以按照全年一次性奖金的计税方式来计算个人所得税。然而，也可以选择不采用此计税方法，而是将其并入员工的综合所得中，与当月工资一同计算，即将年底双薪平均到12个月，根据月均数来确定适用税率和速算扣除数，从而计算应缴纳的个人所得税。
2、若员工同时获得年底双薪及年终奖等一次性奖金
根据国税发〔2005〕9号文第三条的规定，每个纳税年度内，对每位纳税人而言，该计税方法只允许采用一次。这意味着在年底双薪和年终奖之间只能选择一种方式按全年一次性奖金计税办法来计算个人所得税。另一种则应并入发放当月的工资薪酬所得中计税。当然，也可以通过财务筹划，将年底双薪与年终奖合并，统一按全年一次性奖金计税办法来计算个人所得税。
