增值税专用发票抵扣联并非原始凭证，其作用主要是用于认证抵扣。在认证相符后，抵扣联应与认证结果通知书一起单独存放，以备后续检查使用。为了方便管理和查阅，每年年末时，企业需要将一年的增值税专用发票抵扣联和认证结果通知书装订成册，与其他
会计档案一起存档。
然而，在某些情况下，如果发票联丢失，企业可以采取一些替代措施来处理。例如，可以使用发票联代替发票联入账。这种情况下，企业需要确保替代的发票联是真实有效的，并且能够提供相应的证明文件，以确保账务的准确性和合规性。
此外，对于增值税专用发票抵扣联的使用和管理，企业还需要注意以下几点：
1. 抵扣联的保管：企业应妥善保管增值税专用发票抵扣联，确保其安全、完整。同时，应建立相应的管理制度，明确责任人和保管期限，以防止抵扣联的丢失或损坏。
2. 抵扣联的认证：企业在收到增值税专用发票抵扣联后，应及时进行认证。认证的目的是确认抵扣联的真实性和有效性，以便正确计算企业的进项税额。
3. 抵扣联的归档：企业应按照规定的时间节点，将一年的增值税专用发票抵扣联和认证结果通知书进行归档。归档时，应按照一定的分类和编号规则进行整理，以便于后续的查阅和使用。
总之，增值税专用发票抵扣联在企业的财务管理中起着重要的作用。企业应加强对抵扣联的管理，确保其合规性和准确性，为企业的财务决策提供可靠的依据。
