存货清查净损失的计算主要涉及以下几种情况：
首先，当存货短缺是由于计量收发差错和管理不善等原因引起的时，我们应先扣除残料价值、可以收回的
保险赔偿和过失人赔偿。然后，将净损失计入管理费用。这是因为存货短缺是由于公司内部原因导致的，因此应由公司自行承担损失。
其次，当存货毁损是由于自然灾害等非常原因引起的时，我们应先扣除处置收入、可以收回的保险赔偿和过失人赔偿。然后，将净损失计入营业外支出。这是因为存货毁损是由于不可抗力因素导致的，与公司的经营活动无关，因此应由公司进行特殊处理。
在存货清查净损失的计算中，我们需要根据具体情况采取不同的处理方式。对于由公司内部原因导致的存货短缺，应将其净损失计入管理费用，以反映公司在存货管理方面的不足。而对于由不可抗力因素导致的存货毁损，应将其净损失计入营业外支出，以突出其对公司经营活动的影响。
总之，存货清查净损失的计算需要根据不同情况采取相应的处理方式。通过扣除残料价值、保险赔偿和过失人赔偿，我们可以准确计算出存货清查的净损失，并根据实际情况将其计入管理费用或营业外支出。这样可以确保公司对存货清查净损失的处理符合会计准则的要求，同时也能够更好地反映公司的经营状况和风险控制能力。
