物流公司在办理税务注销时，需要遵循以下步骤：
首先，向主管税务机关提交注销申请，并领取和填写注销税务登记申请审批表。这是整个流程的第一步，也是最关键的一步。
其次，交回发放的全部证件和未使用的发票。这一步是为了确保公司的所有财务记录都是完整和准确的。同时，也需要结清税款，并领取防伪税控系统清缴登记表。
接下来，按照管理税务所实际清缴的增值税专用发票的数量，在防伪税控系统中进行发票退回和清缴。这一步是为了确保公司的税务记录是准确无误的。
然后，清缴税款后，需要提交注销税务所需要的资料。这一步是为了确保公司的税务注销过程能够顺利进行。
最后，完成注销后，公司将取得清税证明。这是证明公司已经完成税务注销的重要文件。
总的来说，物流公司在办理税务注销时，需要遵循以上五个步骤。每一步都是必要的，也是非常重要的。只有严格按照这些步骤进行，才能确保公司的税务注销过程能够顺利进行。
