代扣个人所得税的操作流程如下：
首先，在工资发放时进行扣发再缴纳。具体步骤如下：
1. 计提工资： 借：管理费用—工资 贷：应付职工薪酬—工资
2. 发放工资： 借：应付职工薪酬—工资 贷：银行存款 其他应付款—个人
社保 应交税费—个人所得税
3. 缴个税时： 借：应交税费—个人所得税 贷：银行存款
4. 社保计提： 借：管理费用—社保单位 贷：应付职工薪酬—社保单位
5. 缴社保时： 借：应付职工薪酬—社保单位 其他应付款—个人社保 贷：银行存款
以上是代扣个人所得税的操作流程，通过工资发放时进行扣发再缴纳的方式进行操作。
