开农产品收购发票的基本流程如下：
1. 购货方与销货方签订农产品采购协议，确定每个品种的质量、数量和价格。 2. 购货方根据销货方交付的原产地证明，按照约定的费用、数量和质量进行验收。 3. 购货方在现场签发收货单，确认收货，并开具农产品收购发票。 4. 购货方向销货方支付采购款项。 5. 购货方可根据市场行情，选择农产品的经营方式，供应市场或其他企业。 6. 对于购销两方都认可的农产品，双方应签订农产品收购合同，以确保双方利益。 7. 销货方和购货方应在发票上注明相应的财务信息、具体的采购数量和货物品种，以及采购前后的变更。 8. 发票相关资料，包括发票抬头、发票号码、发票代码、税务登记证等，均要妥善保存，并做好归档处理。 9. 购货方和销货方应及时完成税务报告，并保留纳税凭证，以备查验。
拓展知识：开农产品收购发票时，发票上所列资料应详尽完整，税率应当根据不同的商品的属性不同而加以区分，以免出现税收纠纷。发票应根据当时收货付款的情况开具，并且发票内容能反映出原始采购协议中商品名称、数量、单价、金额等信息，以及购货方和销货方的真实名称等。
