小规模纳税人开具的专票和普票存在几个显著的区别。首先，它们的开具方式不同。小规模纳税人需要在完税凭证管理系统注册并登录后，在系统中开具普通发票。相比之下，专用发票则由小规模纳税人手工开具。
其次，发票内容也有所不同。专用发票的内容由收款方填写，而普通发票的内容则由付款方填写。
税率方面，专用发票采用固定税率，大多数情况下为3%。普通发票的税率可以根据实际发生的情况自由选择，可以是3%或者6%。
税额核算方法也存在差异。专用发票采用比例法核算税额，即税额等于不含税金额乘以税率。普通发票则采用计算法核算税额，税额等于不含税金额乘以税率减去金额。
此外，发票的使用方式也不同。专用发票可以作为认证的税务凭证，用于纳税抵扣。而普通发票则不能用作认证的税务凭证，只能作为收入证明使用。
最后，开票时间也有差异。专用发票一般在当天开具，通常在2天内可以完成开票。普通发票则一般在收到税款后开具，开票时间可以拖延至2周左右。
除了上述区别，小规模纳税人还可以通过记账凭证进行税务记账。记账凭证可以分为支出收据、银行对账单和企业收入发票三类。支出收据主要用于核实发生的支出，银行对账单可以用于核实银行存款情况，企业收入发票则可以用于核实企业的营业收入情况。
