房产税是以房屋为征税对象，按房屋的计税余值或租金收入为计税依据，向产权所有人征收的一种财产税。
土地使用税是指在城市、县城、建制镇、工矿区范围内使用土地的单位和个人，以实际占用的土地面积为计税依据，依照规定由土地所在地的税务机关征收的一种税赋。由于土地使用税只在县城以上城市征收，因此也称城镇土地使用税。
《房产税暂行条例》第二条规定，房产税由产权所有人缴纳。产权属于全民所有的，由经营管理的单位缴纳，产权出典的，由承典人缴纳。产权所有人、承典人不在房产所在地的，或者产权未确定及租典纠纷未解决的，由房产代管人或者使用人缴纳。
《国家税务局关于签发〈关于土地使用税若干具体问题的解释和暂行规定〉的通知》（（1988）国税地字第15号）规定，土地使用税由拥有土地使用权的单位或个人缴纳。拥有土地使用权的纳税人不在土地所在地的，由代管人或实际使用人纳税;土地使用权未确定或权属纠纷未解决的，由实际使用人纳税;土地使用权共有的，由共有各方分别纳税。
因此，拥有土地使用权的纳税人不在土地所在地或者土地使用权未确定或权属纠纷未解决的，由实际使用人缴纳土地使用税。
1.征收对象不同：房产税是在房产用于经营的时候征收的，提醒您，如房产用于自己经营工厂、商铺，或用于出租，都要缴纳房产税。土地增值税是在土地或者地上建筑物发生转让时，按照土地增值额征收的。如发生房产转让时，应按相关规定计算土地增值额，在按土地增值额征收土地增值税。城镇土地使用税与房产税类似，是土地或地上建筑物用于经营是征收的。如当房产用于出租时，出征收房产税外，还要按土地的面积征收城镇土地使用税。
2.计税方式不同：房产税是按照房产原值或租金征税。土地增值税是按照土地增值额计税。土地使用税是按照土地面积征税。
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