第一步，立案
立案就是执法部门对于发现或接到投诉、举报等事实或者材料后，认为有违法事实发生或存在并需要追究法律责任时，决定把它作为行政案件进行查处的一种活动。这个程序中要注意哪些行政机关有权立案查处违章建筑：
1、规划局或者规划委员会。这是法定部门，城市里的违章建筑由它来管。
2、城市管理综合行政执法局。也就是大名鼎鼎的城管，城管有没有权利来管违章建筑，主要看它是否得到省级政府的授权，比如北京，城管部门是得到北京市政府的授权的，所以那个有名的人济山庄的违章建筑就是城管要求限期自行拆除的。
3、乡、镇人民政府。它的执法范围是乡、村庄规划区范围内，简单讲就是在农村的违章建筑由它来管。除了上述部门，其他部门都没有权利查处违章建筑。实践中有国土局或者国土所、住房和城乡局、房管局等来查处违章建筑的，这是错误的。
第二步，调查程序
在调查中，应当注意以下几点：
1、调查人员不得少于2个人。
2、调查人员要主动出示执法证件。有两个作用：一是调查人员必须具备执法资格;二是防止没有执法资格的人冒充执法人员进行执法活动。在实践中，很多地方得执法人员在调查时往往是不出示执法证件的。面对这种情形，建议被处罚的人可以主动要求他们出示证件，并记录下他们证件上的相关信息（比较重要的信息有姓名、编号等），这样方便日后维权。
3、在被询问以及在签署笔录时要谨慎。一是不要害怕，绝大部分拆迁户一见到政府人员询问或是调查就吓个半死，这是十分要不得的，因为在恐惧和害怕中往往会出错。二是不该说的不要说，实践中有些执法人员会用威逼利诱的手段让你说一些方便他们调查的话，比如如果你不老实交代会从严处理等等。三是在笔录上签字要小心谨慎。
第三步，决定程序
1、告知，听取陈述、申辩。这个主要是保证被处罚人的知情权、陈述权、申辩权。执法人员在作出处罚决定前，一般会书面告知被处罚人行政处罚的事实、理由和依据。被处罚人有权陈述、申辩，如果执法人员拒绝听取当事人的陈述、申辩，行政处罚决定不能成立。
2、听证。听证是指行政机关实施行政处罚过程中，在作出决定前，由非本案调查人员主持，听取调查人员提出当事人违法的事实、证据和行政处罚建议与法律依据，并听取当事人的陈述、举证、质证和申辩及意见的程序活动。《行政处罚法》第四十二条规定，行政机关作出责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款等行政处罚决定之前，应当告知当事人有要求举行听证的权利;当事人要求听证的，行政机关应当组织听证。当事人不承担行政机关组织听证的费用。对于听证程序，建议被处罚人还是要重视一下不要错过这个程序。错过这个程序，虽然可以在这之后的比如行政复议、行政诉讼程序中得到救济。但我建议你还是不要错过听证。
第四步，处罚决定书的送达和执行
执法机关如果决定要进行处罚，会作出并向被处罚人送达《行政处罚决定书》。
一般情况下，拆除违建，拆迁者无需补偿，但某些情形下，被拆迁者可获得相关的赔偿。
1、如果是取得土地使用权的违章建筑，拆迁人在拆迁违建的过程中，因拆迁给土地使用权造成损害的，应适当予以补偿。如果土地使用权是通过出让方式得来，违法建筑人缴足了土地出让金，但未到出让年限的，拆迁人也应补偿被拆迁人造成的土地使用收益的损失。如果土地使用权是通过划拨方式得来的，拆迁人可以不补偿使用该土地的违章建筑人。
2、违章建筑内的财产可以独立于违章建筑存在，系违章建筑人的合法财产，依法应当受到保护。拆迁人在拆迁的过程中要注意先提醒被拆迁者，搬迁并保护好个人财产，拆迁人对违章建筑内的财产不施加任何保护措施，造成被拆迁人财产受到损失的，被拆迁人可请求相应的赔偿。
3、违建一般情形虽然不能获得拆迁补偿，但可申请拆迁赔偿，拆迁人在拆迁过程中，由于拆迁程序和手段违法，侵害了被拆迁人和房屋承租人的合法权益时应当依法赔偿损失。被拆迁人的利益受损的，可提出赔偿损失的要求。
根据我国法律的规定如果说，违章建筑属于没有任何批文或证件的建筑，有关部门进行强制拆除之后是不进行任何经济补偿的。如果说，这些违章建筑没有被有关部门执行过强拆，那么在进行过拆除之后，有关部门会根据当地的房价以及物价水平，进行评估之后，做出相应的补偿。
还有一种情况是，当地农村的房子存在违章现象。而在我国农村一般情况下房屋是没有这些产权证件的。对于这种情况来说，我国政府为了维护广大人民群众的利益，政府是会进行一定额度的补偿的。这些房屋的补偿标准一般按照当地有证件的房屋补偿价格进行补偿。如果当地农村没有，不存在有证件的房屋，那么在进行违章建筑拆除之后，我们可以根据有关部门对当地的物价水平作出的评估，来设立一个补偿标准，进行补偿。
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