专利申请权转让所书立的合同，按照印花税税目税率表的规定，适用“技术合同”税目。
专利申请权以及非专利技术转让所书立的合同，不同于专利权转让、专利实施许可所书立的合同、书据，对于前者应适用“技术合同”税目按万分之三税率缴纳印花税；而后者，则应适用“产权转移书据”税目，按万分之五的税率计算缴纳印花税。
提醒您，印花税计税依据根据应税凭证的性质分别规定有以下几种：
1.合同或者具有合同性质的凭证，以凭证所载金额作为计税依据。
2.营业账簿中记载资金的账簿，以实收资本和资本公税总额作为计税依据。
3.不记载金额的权利许可证照：营业执照、专利证、房屋产权证等，以及企业的日记账簿和各种明细分类账簿等辅助性账簿，按凭证或账簿的件数纳税。
印花税，是税的一种，是对合同、凭证、书据、账簿及权利许可证等文件征收的税种。纳税人通过在文件上加贴印花税票，或者盖章来履行纳税义务。现行印花税只对印花税条例列举的凭证征税。
合同类型不同，印花税税率也是不一样的，介绍几种常见的合同印花税税率：
1.购销合同，包括供应、预购、采购、购销、结合及协作、调剂等合同，按购销金额0.03％贴花；
2.建筑安装工程承包合同，按承包金额0.03％贴花；
3.技术合同，包括技术开发、转让、咨询、服务等合同，按所载金额0.03％贴花；
4.借款合同，包括银行及其他金融组织和借款人，按借款金额0.005％贴花；
5.财产租赁合同，包括租赁房屋、船舶、飞机、机动车辆、机械、器具、设备等合同，按租赁金额1‰贴花。税额不足1元，按1元贴花；
6.仓储保管合同，按仓储保管费用0.1％贴花，仓单作为合同使用的，按合同贴花。
