首套房契税计算方式为，买房产契税应纳税额等于计税依据乘以相应的税率。个人购买首套住房且面积在90平方米以下的可以按照1%来进行征收房产契税。
首套房契税的计算方式为：买房产契税应纳税额＝计税依据×税率。个人购买首套普通住宅契税减半征收。契税税率的规定是3％－5％，一般取3％为了支持房地产业，政府对一般商品房减半收税。
1.个人购买普通住房，且该住房为家庭唯一住房的，所购普通商品住宅户型面积在90平方米(含90平方米)以下的，契税按照1%执行;
2.户型面积在90平方米到144平方米(含144平方米)的，税率减半征收，即实际税率为2%；
3.所购住宅户型面积在144平方米以上的，契税税率按照3%征收。
首套房契税是可以退的。法律快车提醒您，纳税人已按预售面积、预售房款缴纳契税，但办理房产证时，发现实测面积与预售面积有误差，导致房款发生变化，致使纳税人多缴税款的，可以申请退税。
法律依据：
《中华人民共和国税收征收管理法》第五十一条
纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还；涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。
首套房卖了再买房贷款未结清的算二套房，贷款已结清的不算二套房。首套房是指购买仅拥有一套住房，中国人民银行规定我国城市居民购买第一套住房享有按揭贷款利率优惠和最低首付比率等优惠政策。
法律依据：
《关于进一步做好房地产市场调控工作有关问题的通知》第六条 原则上对已拥有1套住房的当地户籍居民家庭、能够提供当地一定年限纳税证明或社会保险缴纳证明的非当地户籍居民家庭，限购1套住房；对已拥有2套及以上住房的当地户籍居民家庭、拥有1套及以上住房的非当地户籍居民家庭、无法提供一定年限当地纳税证明或社会保险缴纳证明的非当地户籍居民家庭，要暂停在本行政区域内向其售房。
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