医保局的单位性质是国家行政机关，隶属于当地人力资源和社会保障局。
负责受理基本医疗保险、工伤保险、生育保险和离休干部医药费统筹基金的核定、支付、管理以及其它日常事务，为参加基本医疗保险、工伤保险和生育保险的用人单位、职工、离休干部提供相应的管理服务。
医保办隶属于当地人力资源和社会保障局。
法律依据：《中华人民共和国社会会保险法》 第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度,保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
医保局为政府组成部门，归政府管理。
主要职能是：
（一）参与起草医疗保险、生育保险、医疗救助等医疗保障制度的单行条例、州政府规范性文件和政策措施、规划、标准并组织实施。
（二）监督管理医疗保障基金，建立健全医疗保障基金安全防控机制，推进医疗保障基金支付方式改革。
（三）组织制定医疗保障筹资和待遇政策措施，完善动态调整和区域调剂平衡机制，统筹城乡医疗保障待遇标准，建立健全与筹资水平相适应的待遇调整机制。健全完善大病保险制度，推进长期护理保险制度改革。
（四）贯彻执行国家制定的药品、医用耗材、医疗服务项目、医疗服务设施等医保目录和支付标准，制定州管医保目录和支付标准并组织实施。
（五）贯彻执行国家和省药品、医用耗材价格及医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策措施，建立医保支付医药服务价格合理确定和动态调整机制，推动建立市场主导的社会医药服务价格形成机制，建立价格信息监测和信息发布制度。
（六）贯彻执行国家药品、医用耗材的招标采购政策措施，监督定点医药机构采购、使用国家和省谈判药品、招标药品及医用耗材品种，统筹全州药品、医用耗材招标采购平台建设。
（七）贯彻执行国家定点医药机构协议管理办法及支付管理办法。建立健全全州医疗保障信用评价体系和信息披露制度，监督管理纳入医保范围的医疗服务行为和医疗费用，依法查处医疗保障领域的违法违规行为。
（八）负责医疗保障经办管理、公共服务体系和信息化建设。组织制定和完善异地就医管理和费用结算政策措施，建立健全医疗保障关系转移接续制度。开展医疗保障领域对外合作交流。
（九）完成上级交办的其他任务。
医保局和社保局是一个单位，现在都隶属于当地人力资源和社会保障局。 医保局是负责受理基本医疗保险、工伤保险、生育保险和离休干部医药费统筹基金的核定、支付、管理以及其它日常事务，为参加基本医疗保险、工伤保险和生育保险的用人单位、职工、离休干部提供相应的管理服务。 社保局为人力资源和社会保障局下属行政事务机构，负责全市社会保险基金的征收和管理
国家医疗保障局设下列内设机构：
（一）办公室。负责机关日常运转，承担安全、保密、信访、政务公开和国际合作交流等工作。
（二）规划财务和法规司。组织拟订医疗保障工作规划。承担机关和直属单位预决算、机关财务、资产管理、内部审计工作，推进医疗保障信息化建设。组织起草法律法规草案、规章和标准，承担规范性文件的合法性审查工作，承担行政复议、行政应诉等工作。
（三）待遇保障司。拟订医疗保障筹资和待遇政策，统筹城乡医疗保障待遇标准。统筹推进多层次医疗保障体系建设。建立健全医疗保障关系转移接续制度。组织拟订长期护理保险制度改革方案并组织实施。
（四）医药服务管理司。拟订医保目录和支付标准，建立动态调整机制，制定医保目录准入谈判规则并组织实施。拟订定点医药机构医保协议和支付管理、异地就医管理办法和结算政策。组织推进医保支付方式改革。组织开展药品、医用耗材、医疗技术的经济性评价。
（五）医药价格和招标采购司。拟订药品、医用耗材价格和医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策并组织实施，建立价格信息监测和信息发布制度。拟订药品、医用耗材的招标采购、配送及结算管理政策并监督实施，推进招标采购平台建设。
（六）基金监管司。拟订医疗保障基金监督管理办法并组织实施。建立健全医疗保障基金安全防控机制，建立健全医疗保障信用评价体系和信息披露制度。监督管理纳入医保支付范围的医疗服务行为和医疗费用，规范医保经办业务，依法查处医疗保障领域违法违规行为。
（七）机关党委（人事司）。负责机关和在京直属单位的党群工作。承担机关和直属单位的人事管理、机构编制、教育培训、队伍建设等工作。
归国家医疗保障局管理——
国家医疗保障局的主要职责是，拟定医疗保险、生育保险、医疗救助等医疗保障基金，完善国家异地就医管理和费用结算平台，组织制定和调整药品、医疗服务价格和收费标准，制定药品和一用耗材的招标采购政策并监督实施，监督管理纳入医保范围内的医疗机构相关服务行业和医疗费用等。
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