1、所属类型不同：FOF基金基金属于主动型基金；指数基金属于被动型基金。
2、交易场所不同：FOF基金场外基金，不在证券交易所交易；指数基金既有场外基金，又有场内基金，场内基金在证券交易所交易。
3、投资标的不同：FOF基金资标的主要是一篮子基金，不直接投资股票或者债券；指数基金投资的是一篮子股票，指数基金以特定的指数为跟踪对象，买入指数中全部或者部分成份股。
