零余额账户的概念来看，它是办理预算资金支付清算的账户。而就零余额账户的运作过程来看，它是一个过渡性账户。
当符合预算规定的商品或劳务政府购买活动已经发生或完成，财政部门或其授权的预算单位向零余额账户发出支付指令，零余额账户在向商品或劳务供应商支付后，于日终前向国库单一账户申请清算，由国库单一账户将资金支付到零余额账户。可见，零余额账户的实质是过渡性支付清算账户。
零余额账户的意思是指财政部门为本部门和预算单位在商业银行开设的账户，用于财政直接支付和财政授权支付及清算。零余额账户是实现对预算资金最终付款控制的必要的技术手段。
财政部零余额账户用于财政直接支付。该账户每日发生的支付，于当日营业终了前与国库单一账户清算；营业中单笔支付额5 000万（含5 000万）元人民币以上的，应及时与国库单一账户清算。财政部零余额账户在国库会计中使用。 预算单位零余额账户用于财政授权支出。该账户每日发生的支付，于当日营业终了前由代理银行在财政部批准的用款额度内与国库单一账户清算；营业中单笔支付额5 000万（含5 000万）元人民币以上的，应及时与国库单一账户清算。
财政授权的转账业务一律通过预算单位零余额账户办理。预算单位零余额账户在行政单位会计和事业单位会计中使用。
1、零余额账户是指财政部门为本部门和预算单位在商业银行开设的账户，用于财政直接支付和财政授权支付及清算。
2、省级一级预算单位及无主管部门的行政事业单位，须填写《银行账户审批表》报省财政厅（基层预算单位填写《银行账户审批表》，报主管部门，主管部门还须填写《财政授权支付银行开户情况汇总申请表》，连同基层预算单位的《银行账户审批表》一并报省财政厅）；《银行账户审批表》经省财政厅审批后报人民银行，人民银行按规定核发《开户许可证》，预算单位持《开户许可证》，在省财政厅确定的代理银行所属分支机构内，自主选择预算单位零余额账户的开户银行，办理零余额账户开户和印鉴预留手续。
3、预算单位在改革实施前已由财政拨付的资金，继续在原开设的银行账户中使用和核算；原账户中相关用途的财政资金使用完毕后，从新开设的预算单位零余额账户中按规定支用有关款项。
零余额账户是国家财政向商业企业或者政府采购项目等的收款方支付款项时，并不是直接把资金交付给收款方，而是设立一个中间过渡的账户，进行资金清算。
举例说明：某政府采购项目采购汽车，花了100万元，按理，财政应该把资金直接支付给汽车公司。
但是，为了保证支付环节可控，账务清楚，财政在某商业银行为它自己或者自己的预算部门开立一个零余额账户，财政先向零余额账户下达支付指令，告诉它要向某汽车公司支付100万元。
零余额账户在收到指令后，立即向汽车公司付款100万元，回头再向财政申请，把钱还给自己。
于是，财政把资金划给零余额账户。此时，经历过一付一收后，账户余额变成零，账务也平了。
基本存款账户是一家单位（可以是企业事业单位或者其它单位）办理转账结算和现金收付的主账户，这家单位的日常经营活动都可以通过基本账户办理。
零余额账户是指财政部门为本部门和预算单位在商业银行开设的账户，用于财政直接支付和财政授权支付及清算。
财政部门
财政部门零余额账户用于财政直接支付。该账户每日发生的支付，于当日营业终了前与国库单一账户清算；营业中单笔支付额5 000万（含5 000万）元人民币以上的，应及时与国库单一账户清算。财政部零余额账户在国库会计中使用。
预算单位
预算单位零余额账户用于财政授权支出。该账户每日发生的支付，于当日营业终了前由代理银行在财政部批准的用款额度内与国库单一账户清算；财政授权的转账业务一律通过预算单位零余额账户办理。预算单位零余额账户在行政单位会计和事业单位会计中使用。
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